Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms