Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms