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| BRD3 | Q15059 | Z97055.1-201 | ENST00000419730 | 712 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | EIF1AX-AS1-201 | ENST00000424026 | 378 nt | TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTATP6P17-201 | ENST00000431030 | 672 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | TEX41-265 | ENST00000627785 | 704 nt | TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | R3HDM1-220 | ENST00000628915 | 4325 nt | TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | PHEX-201 | ENST00000379374 | 6172 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZC3H14-215 | ENST00000555900 | 1762 nt | TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC024560.2-201 | ENST00000507981 | 1497 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | FRG1BP-201 | ENST00000278882 | 761 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP87-201 | ENST00000384155 | 118 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU5A-2P-201 | ENST00000384337 | 116 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-882P-201 | ENST00000391025 | 103 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | CFHR3-203 | ENST00000391985 | 1043 nt | TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007066.1-201 | ENST00000392902 | 381 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS3AP26-201 | ENST00000398259 | 784 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| BRD3 | Q15059 | HMGB1P11-201 | ENST00000413899 | 637 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000432.1-201 | ENST00000416641 | 516 nt | TSL 3 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC119751.6-201 | ENST00000416712 | 186 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005828.1-201 | ENST00000431604 | 524 nt | TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS3AP54-201 | ENST00000435535 | 734 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC104308.1-201 | ENST00000454621 | 333 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| BRD3 | Q15059 | SNORD121B-201 | ENST00000458838 | 81 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC010486.2-201 | ENST00000505572 | 483 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022447.3-201 | ENST00000506865 | 495 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091906.1-201 | ENST00000511310 | 391 nt | TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-528P-201 | ENST00000516926 | 100 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNRPGP16-201 | ENST00000533275 | 226 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02442-202 | ENST00000540761 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL110118.1-201 | ENST00000553543 | 400 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AGBL1-AS1-203 | ENST00000566878 | 865 nt | TSL 3 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005899.1-201 | ENST00000584125 | 563 nt | TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4527HG-203 | ENST00000600127 | 704 nt | TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011451.2-201 | ENST00000604303 | 598 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SL722P-201 | ENST00000617780 | 284 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SL565P-201 | ENST00000618246 | 284 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCBP1-AS1-348 | ENST00000629506 | 667 nt | TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL158064.1-201 | ENST00000627044 | 2242 nt | TSL 4 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | ADAM29-201 | ENST00000359240 | 3325 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC046195.1-201 | ENST00000518973 | 4171 nt | TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | TOX-201 | ENST00000361421 | 4131 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNF180-202 | ENST00000389100 | 4906 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | GDAP2-202 | ENST00000369443 | 8828 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079160.1-202 | ENST00000508406 | 2795 nt | TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | GPAM-201 | ENST00000348367 | 6371 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC125257.1-201 | ENST00000560400 | 2930 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTND4P16-201 | ENST00000466108 | 1367 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | ANKRD36C-202 | ENST00000456556 | 5428 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF322-205 | ENST00000471278 | 2675 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.169-201 | ENST00000363745 | 96 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | C20orf187-201 | ENST00000378252 | 446 nt | TSL 2 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR51I1-201 | ENST00000380211 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR3074-201 | ENST00000384885 | 81 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD66.1-201 | ENST00000391230 | 76 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | SPRR2A-201 | ENST00000392653 | 709 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4-72P-201 | ENST00000410754 | 173 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| BRD3 | Q15059 | COX6CP17-201 | ENST00000421389 | 185 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |