Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CACNA1SQ13698 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms