Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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