Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ITGB3BPQ13352 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ITGB3BPQ13352 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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ITGB3BPQ13352 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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ITGB3BPQ13352 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
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ITGB3BPQ13352 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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ITGB3BPQ13352 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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ITGB3BPQ13352 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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ITGB3BPQ13352 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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