Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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NR1H3Q13133 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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