Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms