Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NPRL3Q12980 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms