Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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