Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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BPTFQ12830 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
BPTFQ12830 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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BPTFQ12830 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
BPTFQ12830 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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