Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRAP18433 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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