Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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