Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RNF20Q5VTR2 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms