Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CSHL1Q14406 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CSHL1Q14406 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms