Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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C1orf61Q13536 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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C1orf61Q13536 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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C1orf61Q13536 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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C1orf61Q13536 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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C1orf61Q13536 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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C1orf61Q13536 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C1orf61Q13536 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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