Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMAD4Q13485 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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