Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRDP23468 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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