Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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CLDN9O95484 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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CLDN9O95484 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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CLDN9O95484 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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CLDN9O95484 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLDN9O95484 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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