Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms