Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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