Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BHMTQ93088 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms