Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms