Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MSMPQ1L6U9 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms