Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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