Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms