Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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