Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRMP28827 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRMP28827 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRMP28827 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRMP28827 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRMP28827 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRMP28827 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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