Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAX2Q9UIW0 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAX2Q9UIW0 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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