Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDGFDQ9GZP0 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms