Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SALL3Q9BXA9 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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SALL3Q9BXA9 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SALL3Q9BXA9 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SALL3Q9BXA9 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SALL3Q9BXA9 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SALL3Q9BXA9 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SALL3Q9BXA9 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SALL3Q9BXA9 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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