Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FXNQ16595 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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