Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GAPVD1Q14C86 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GAPVD1Q14C86 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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