Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IHHQ14623 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IHHQ14623 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IHHQ14623 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IHHQ14623 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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