Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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