Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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