Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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