Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN13Q12923 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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