Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms