Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 BTK-202ENST00000372880 2248 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LARGE-AS1-203ENST00000438159 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CACNB1Q02641 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 523.2 ms