Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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