Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms