Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF3AQ9Y496 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms