Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SETD1BQ9UPS6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SETD1BQ9UPS6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms