Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms