Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms