Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms