Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
USP36Q9P275 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP36Q9P275 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms