Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms