Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA3Q9NZ52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA3Q9NZ52 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms