Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms